二、母子不分，层次混乱
在分层次的时候，同一层的分类要用同一个番舸榆毛标准，母概念和子概念不应并列。章断条连结构是并列结构，要求公文的每个部分内，流水序数引领的各意义段之间，均应为并列关系。不少指示、知照类公文结构较为复杂，往往大层次套中层次、中层次套小层次，只用一种层次的序数标领，写作时就需颇费斟酌。如果不熟悉章断条连式的要求，在具体行文中，母、子概念段并列的毛病就会常常出现。例如，《×××面向二十一世纪教育振兴行动计划》，其第六部分的标题是：“实施‘现代远程教育工程’，形成开放式教育网络，构建终身学习体系”，下面包括第20条至25条共六个意义段。其中，第20条讲的是实施现代远程教育工程的要求、重要作用和战略意义；第21至24条具体讲了实施现代远程教育工程的几项工作，即扩大中国教育科研网的传输容量和联网规模、发挥好卫星电视教育在现代远程教育中的作用、开发高质量的远程教育软件、对现代远程教育工作实行归口管理。不难看出，第20条是总述，属于母概念；第21至24条为分述，均为子概念。前后之间是从属关系。按并列结构的要求，应将第21至24条合并为一条(为了清晰起见，这一条内仍可分为四个自然段来写)，才能与第20条形成并列关系。但是该文将四个属于子概念的意义段独立成条，这样就把从属关系错为并列关系，造成了层次上的混乱。“意见”、“通知”等文种采用章断条连式后，这类毛病尤为突出。
三、内容交叉，前后重复
一个意思未说完，又说第二个意思，在下一个意义段里回过头来再补充说明第一个意思；或者上一个意义段里说过的，到下一个意义段又变换角度再说，这都是对章断条连式运用不当而产生的问题。如，《×××关于进一步深化城镇住房制度改革加快住房建设的通知》，它的第七部分有如下三条： (二十五)加快改革现行的住房维修、管理体制，建立业主自治与物业管理企业专业管理相结合的社会化、专业化、市场化的物业管理体制。 (二十六)加强住房售后的维修管理，建立住房公用部位、设备和小区公共设施专项维修资金，并健全业主对专项维修资金管理和使用的监督制度。 (二十七)物业管理企业要加强内部管理，努力提高服务质量，向用户提供质价相符的服务，不得只收费不服务或多收费少服务，切实减轻住户负担。物业管理要引入竞争机制，促进管理水平的提高。有关主管部门要加强对物业管理企业的监管。 分析上面三段可以看出，第(二十五)条是从体制上说如何加强住房维修管理和物业管理，第(二十六)、(二十七)条是分别具体说如何加强住房维修管理、物业管理，也涉及到体制的问题。如果这二段不加流水序数，可以看作是一个意义段里的三个自然段，这么写没有什么毛病。一旦加上流水序数就成了三个意义段，好象加了三道闸门，三段之间必须意思分明，前后内容不能交叉、重复。上面该文的写法显然是有问题的，如第(二十六)条实际上就是对(二十五)条说的改革住房维修管理体制的具体化，是一种内容上的交叉。